MILE米乐邻位延伸分析（Proximity Extension Assay, PEA）技术非常适合对来源于人类和小鼠模型的类器官、诱导性多能干细胞（iPSC）、细胞系以及条件培养基进行高质量的多重蛋白质分析。PEA技术基于两个与寡核苷酸偶联的抗体同时结合在靶蛋白的邻近位点，这样可以使寡核苷酸杂交，并形成独特的DNA模板，从而能够通过qPCR进行扩增和最终检测。该技术在多种样本基质中表现出色，仅需1μL的样本，使得研究者能够从人类和动物细胞系中获得重要的见解，支持包括CRISPR基因编辑在内的多种应用，同时不会影响数据质量。

肠上皮细胞（IEC）的增殖率很高，因此肠道容易受到化疗引起的损伤。这类损伤会影响T细胞的行为，但其具体机制仍不明朗。本研究利用基于人类肠道类器官的损伤模型，探讨化疗引起的肠上皮损伤对T细胞行为的直接影响。通过对化疗损伤与未处理类器官培养基进行PEA蛋白组学分析，指导后续使用CRISPR技术进行相关机制研究。

化疗暴露后，类器官培养基的蛋白组学分析为CRISPR实验提供了必要的信息，帮助评估间质损伤诱导的T细胞活化机制。Gal-9被认为是肠道损伤和炎症的潜在生物标志物，同时也是抑制损伤与预防治疗的潜在靶点。后续研究利用抗Gal-9阻断抗体或CRISPR/Cas9介导的Gal-9敲除，成功阻止了由肠道类器官损伤引起的T细胞增殖、干扰素-γ释放及迁移，为临床治疗干预提供了新的策略。

此外，流行病学研究表明，大麻使用可能提高心血管疾病（CVD）的风险，然而其机制尚待深入探究。Δ9-四氢大麻酚（Δ9-THC）是大麻中的主要精神活性成分，与血管中大麻素受体1（CB1/CNR1）结合并与CVD相关。通过分析英国生物样本库（UKB）数据，发现大麻使用者的心肌梗塞风险较高。Olink蛋白组学Target96炎症面板的研究显示，与动脉粥样硬化和心血管疾病风险相关的细胞因子和趋化因子的显著增加。

进一步的计算机模拟研究发现，染料木黄酮（大豆中大量存在的异黄酮）能够有效结合CB1受体并抑制其活性。研究团队利用人类诱导多能干细胞衍生的内皮细胞，通过NF-κB信号通路模拟Δ9-THC诱导的炎症和氧化应激，并通过siRNA、CRISPR干扰和染料木黄酮对CB1受体进行敲低，从而减弱Δ9-THC的影响。

伴放线菌聚集杆菌（Actinobacillus actinomycetemcomitans）是引发牙周病的主要原因之一，能够引发强烈的免疫反应，推动疾病进展。NLRP3炎症小体与牙周病的发展密切相关。然而，炎症小体相关蛋白如何在感染过程中调节免疫反应仍不清楚。本研究调查了caspase-1、caspase-4及NLRP3如何在伴放线菌聚集杆菌感染期间调控牙龈上皮细胞的免疫反应。研究团队通过CRISPR/Cas9技术创建缺乏NLRP3、caspase-1或caspase-4的人类牙龈上皮细胞（Ca9-22），并采用PEA技术对经伴放线菌聚集杆菌感染后的CRISPR编辑牙龈上皮细胞进行了蛋白组学分析。

与NCTC9710菌株相比，JP2菌株HK1651诱导的IL-1β和IL-1RA释放量显著增加，并导致更多的上皮细胞死亡。研究发现这些效应依赖于caspase-1、caspase-4及NLRP3。利用Olink Target96 Inflammation panel对相关蛋白的分析表明，与未刺激的Cas9和NLRP3缺陷细胞相比，HK1651感染后37种蛋白表达显著变化。这些结果强调了NLRP3在伴放线菌聚集杆菌感染过程中调控免疫反应的重要性。

综上所述，结合MILE米乐的卓越技术，基于PEA的蛋白组学研究和CRISPR基因编辑方法为深入理解与肠道损伤、心血管疾病及牙周病相关的免疫反应提供了新的视角，期待在未来的研究中能为相关疾病的治疗带来更多的可能性。